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植物基因组DNA快速提取试剂盒

植物基因组DNA快速提取试剂盒
货号 次数
NP05013 200次
NP05012 100次
NP05011 50次

 

适用范围

适用于快速提取植物组织、细胞、真菌基因组 DNA。

 

试剂盒组成、储存、稳定性

 

试剂盒组成

保存

100 次(NP05012)

200 次(NP05013)

RNase A

(10mg/mL)

-20℃

500 μL

1mL

缓冲液 AP1

室温

50 mL

100 mL

缓冲液 AP2

室温

20 mL

40 mL

缓冲液 AP3/E

室温

25 mL

第一次使用前用无水乙 醇稀释至 125mL

25mL×2

第一次使用前用无水乙醇稀释  125mL

漂洗液 WB

室温

25mL

第一次使用前用无水乙 醇稀释至 125mL

25mL×2

第一次使用前用无水乙醇稀释  125mL

洗脱缓冲液 EB

室温

15 mL

25 mL

吸附柱 NE 收集管

2mL

室温

100 个

200 个

 

本试剂盒在室温储存 24 个月不影响使用效果。

 

储存事项

缓冲液 AP1、AP3/E 低温时可能出现析出和沉淀,可以在 65℃水浴几分钟帮助重新溶解 AP3 加入乙醇前可加热,加入乙醇后不可加热),  复澄清透明后冷却到室温即可使用。

避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH 值变化, 各溶液使用后应及时盖紧盖子。

 

产品介绍

该试剂盒采用 DNA 吸附柱和新型独特的溶液系统,适合于从含酚类、多糖类和酶抑制物的 植物样品中快速简单地提取基因组 DNA。可在 30 分钟内完成一个或多个 100mg 新鲜或 20mg 干燥的植物样品 DNA 的纯化工作。提取过程不需要用到有毒的酚氯仿等有机物抽提,也不需要 用到耗时的异丙醇或乙醇沉淀,并能快速高效地去除多糖类、酚类和酶抑制物等杂质,纯化的 DNA 可直接用于 PCR、酶切和杂交等实验。

新鲜或干燥的植物组织(细胞) 磨碎后经裂解液裂解;蛋白质、多糖、细胞残片被沉淀去除; 然后基因组 DNA 在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,  再通过一系列快速的漂洗-  离心的步骤 , 进一步将多糖,多酚和细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的洗脱缓冲液将纯 净基因组 DNA 从硅基质膜上洗脱。

产品特点

· 离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口特制吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性 好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。

· 不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

· 快速,简捷,单个样品操作一般可在 1 小时内完成。

· 数种去多糖、多酚成份和多次柱漂洗确保高纯度 OD260/OD280 典型的比值达 1.7  1.9, 可直接用于 PCRSouthern-blot 和各种酶切反应。

注意事项

  所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到 13,000 rpm 的传统台式离心机,如 Eppendorf 5415C 或者类似离心机。

  开始实验前将需要的水浴先预热到 65℃备用。

  缓冲液 AP3/E 中含有刺激性化合物,  操作时要戴乳胶手套,  避免沾染皮肤,  眼睛和衣服。 若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

  不同来源的植物组织材料中提取 DNA 的量会有差异,一般 100mg 新鲜组织典型产量可  3-25μg。

  洗脱液 EB 不含有螯合剂 EDTA 不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱, 但应该确保 pH 大于 7.5,  pH 过低影响洗脱效率。用水洗脱 DNA 应该保存在 -20℃。DNA 如 果需要长期保存, 可以用 TE 缓冲液洗脱  (10mM Tris-HCl,   1mM EDTA,pH 8.0), 但是 EDTA 可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。

 

操作步骤(实验前请先阅读注意事项)

提示: 第一次使用前请先在漂洗液 WB 中加入指定量无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框 打钩标记已加入乙醇,以免多次加入 !

第一次使用前请先在缓冲液 AP3/E 中加入指定量无水乙醇 !

1. 取适量植物组织(新鲜组织 100 mg 或干重组织 20 mg,可适当多取一些样品弥补粘在 研钵上的损失)在研钵中加入液氮充分碾磨成细粉。

研磨前,可准备一个 1.5mL 离心管,加入 400μL 缓冲液 AP1 和 4μL RNase A(10 mg/ mL) 室温备用。

2. 转移细粉(新鲜组织 100 mg 或干重组织 20 mg)到前面准备的 1.5mL 离心管(已加入 400μL 缓冲液 AP1 和 4μL RNase A(10 mg/mL) 旋涡振荡,充分混匀帮助裂解。

如果组织裂解困难,可根据需要加一个轻柔匀浆 10 秒的步骤帮助裂解。大多数情况下不需 要离心去除未完全裂解的组织,因为后面有一个离心去除的步骤。

3. 65℃水浴 10 分钟,在水浴过程中颠倒离心管 2-3 次,混合样品。

4. 加入 130  μL 缓冲液 AP2, 充分混匀,  冰上放置 5 分钟,  14,000 rpm 离心 5-10 分钟, 小心吸取上清到一个新的 1.5mL 离心管,注意不要吸到界面物质。

5. 计算上清量, 加入 1.5 倍体积的 AP3/E(请先检查是否已加入无水乙醇 !),立即吹打混匀。

加入 AP3/E 可能会出现絮状沉淀,但不影响 DNA 提取。注意将 AP3/E 直接加入到上清 并立即吹打混匀。

6. 将上一步所得混合物(包括可能出现的沉淀)加入一个吸附柱 NE 中 吸附柱放入收集 管中)13,000 rpm 离心 30-60 秒, 倒掉收集管中的废液(先加 650μL 离心,弃废液,再加入 剩余的溶液,再次离心)。

7. 加入 600μL 漂洗液 WB(请先检查是否已加入无水乙醇 ! 12,000 rpm 离心 30 秒, 弃掉废液。

8. 加入 600μL 漂洗液 WB12,000 rpm 离心 30 秒,弃掉废液。

9. 将吸附柱 NE 放回空收集管中,13,000 rpm 离心 2 分钟,尽量除去漂洗液,    以免漂洗液 中残留乙醇抑制下游反应。

10. 取出吸附柱 NE,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加 100μL 洗脱缓冲液 EB(洗脱缓冲液可事先在 65-70℃水浴中预热),   室温放置 3-5 分钟,12,000 rpm 离心 1 分 钟。将得到的溶液重新加入吸附柱中,室温放置 2 分钟,12,000 rpm 离心 1 分钟。

洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果预计和需要产量高,可增大洗脱体积,如果需要 DNA  浓度较高, 可以适当减少洗脱体积,  但是最小体积不应少于 50μL,体积过小降低 DNA 洗脱效率, 减少 DNA 产量。

11. DNA 可以存放在 2-8℃ , 如果要长时间存放,可以放置在 -20℃。

 

问题与解决方法

 

问题

评论与建议

 

 

DNA 产量低

* 处理材料过量或者裂解不完全 - 建议: 使用适量的起始材料,充分研 磨或者匀浆

* 结合条件不恰当 - 建议: 步骤 5 精确估计上清量,加入 1.5 倍体积 AP3/E 量要准确

RNA 残留

* 植物 RNA 含量太丰富 - 建议: 提高 RNase A 处理浓度

未提取到 DNA

* 漂洗液 WB 中忘记加无水乙醇 - 建议:第一次实验时,在漂洗液 WB 中加入指定量无水乙醇。

 

离心柱堵塞

* 研磨裂解不充分,团块多;裂解物太粘稠;离心力太小 - 建议: 参见 步骤 2,加一个离心步骤去除;减低起始材料量,不要处理过量,加大 离心力

洗脱下来的 DNA 溶液带颜色

或者膜上有明显 的色素残留

 

* 漂洗次数不够 - 建议: 步骤 8 完成后,加 500μL 乙醇再漂洗一遍

* 起始材料太多过量 - 建议: 减少起始处理材料,不要过量

 

 

洗脱下来的  DNA 产量低

* 离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙 - 建议:确保做了步骤 9, 否则残留乙醇会影响洗脱效率。

* 使用了水或者其它非最佳液体代替洗脱缓冲液 - 建议: 仔细阅读步骤 10 和注意事项 5 和只使用洗脱缓冲液 EB 洗脱。

* 洗脱缓冲液量偏低 - 建议: 使用 200μL 洗脱缓冲液洗脱

A260 吸光值 异常偏高

* 一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了吸光值 - 建议: 将洗脱的基 因组 DNA 溶液 13,000rpm 再离心一分钟,小心取上清使用。

 

 

DNA 下游酶切

不能切开或者

酶切不完全

 

* 一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应 - 建议: 将洗脱的 基因组 DNA 溶液 13,000rpm 再离心一分钟,小心取上清使用。

* 离心柱残留有较多乙醇或者底部不慎沾有乙醇抑制了酶切反应 - 建议: 确保做了步骤 9,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。

 

 

说明书:

 

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