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组织/细胞RNA快速提取试剂盒

组织/细胞RNA快速提取试剂盒
货号 次数
NP06011 50次

适用范围

适用于快速提取普通动物细胞和易裂解动物组织RNA,使用独有基因组 DNA 清除柱 技术确保有效清除 gDNA 残留,不需要使用 DNase 消化,RNA 可直接用于反转录荧光定量 PCR.,Northern-blot 等下游实验。

试剂盒组成、储存、稳定性

 

试剂盒组成

保存

50 次(NP06011)

裂解液 RLT Plus

室温

50 mL

去蛋白液 RW1

室温

40 mL

漂洗液 RW

室温

10mL

第一次使用前用无水乙醇稀释至 50mL

RNase-free H2O

室温

10 mL

70% 乙醇

室温

9mL RNase-free H2O

第一次使用前用无水乙醇稀释至 30mL

基因组清除柱

DNANE 和收集管

室温

50 

RNase-free

吸附柱 RNANE 和收集管

室温

50 

本试剂盒在室温储存 24 个月不影响使用效果。

 

存储事项

所有的溶液应该是澄清的,如果环境温度低时溶液可能形成沉淀,此时不应该直接使用,可  37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清。

不合适的储存于低温(4℃或者- 20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存 均在室温下(15℃- 25℃)进行。

避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH 值变化, 各溶液使用后应及时盖紧盖子。

产品介绍

该基因组 DNA 清除柱技术确保有效清除 gDNA 留,得到的 RNA 不需要 DNase 消化, 可直接用于反转录 PCR、荧光定量 PCR 等实验。独特的裂解液迅速裂解细胞和灭活细胞 RNA 酶,然后裂解混合物通过一个基因组 DNA 清除柱,基因 DNA 被清除而 RNA 穿透滤过。滤过  RNA 用乙醇调节结合条件后,RNA 在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,  通过一系列快速的漂洗-离心的步骤 , 去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后 低盐的 RNase free H20 将纯净 RNA 从硅基质膜上洗脱。

产品特点

·完全不使用有毒的苯酚,氯仿,Beta 巯基乙醇等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。

·快速,简捷,单个细胞样品操作一般可在 15 分钟内完成。

· 独家研发成功基因组 DNA 清除柱技术确保有效清除 gDNA 残留,得到的 RNA 不需要 DNase 消化,可直接用于反转录 PCR、荧光定量 PCR 等实验。

·多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280 典型的比值达 2.1-2.2(100% 纯的 RNA 比值 一般是 2.2 左右,很多公司的产品因为残留蛋白或者 DNA 较多,造成比值降低,无法达到 2.2 这个纯度标准,因此降低要求 1.9-2.0 就凑合使用了,但是我们的产品标准一般可以达到高水准  2.1-2.2 的纯度标准)。

注意事项

  所有的离心步骤均在室温完成,  使用转速可以达到 13,000 rpm 的台式离心机即可。

  样品处理量绝对不要超过基因组吸附柱 DNANE 和和 RNA 吸附柱 RNANE 处理能力, 否则造成 DNA 残留或者产量降低。不同组织细胞种类 RNA/DNA 相差极大,例如胸腺脾脏 DNA 含量丰富,超过 5mg 就会超过柱子处理能力。COS 细胞 RNA 含量丰富,超过 3x106 细 胞就会超过柱子吸附能力。所以开始摸索实验条件时,如果不清楚样品 DNA/RNA 含量时宁可 使用较少的样品处理量,如细胞不超过 3-4x106,组织不超过 10mg。将来根据样品试验情况 增加或者减少处理量。

  裂解液 RLT Plus 和去蛋白液 RW1 中含有盐酸胍 / 异硫氰酸胍化合物,操作时要戴乳胶 手套, 避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。

  预防 RNase 污染,应注意以下几方面:

1) 经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致 RNase 污染。

2) 使用无 RNase 的塑料制品和枪头避免交叉污染。

3) RNA 在裂解液 RLT Plus 中时不会被 RNase 降解。但提取后继续处理过程中应使用不  RNase 的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在 150℃烘 4 小时,塑料器皿可在 0.5 M NaOH 中浸泡 10 分钟,然后用水彻底清洗,再灭菌,即可去除 RNase。

4) 配制溶液应使用无 RNase 的水。(将水加入到干净的玻璃瓶中,加入 DEPC 至终浓度 0.1%( v/v),37℃放置过夜,高压灭菌。)

  关于 DNA 的微量残留:

一般说来任何总 RNA 提取试剂在提取过程中无法完全避免 DNA 的微量残留(DNase  化也无法做到 100% 无残留 该产品由于采取了本公司独特的缓冲体系和基因组 DNA 清除柱 技术,绝大多数 DNA 已经被清除,不需要 DNase 消化,可直接用于反转录 PCR 和荧光定量 PCR。个别特殊情况如 DNA 含量过于丰富造成残留或者要进行严格的 mRNA 表达量分析荧光 定量 PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:

1) 选用跨内含子的引物 , 以穿过 mRNA 中的连接, 这样 DNA 就不能作为模板参与扩增反应。

2) 选择基因组 DNA 和 cDNA 上扩增的产物大小不一样的引物对。

3) 将 RNA 提取物用 RNase-free  DNase I 处理以提高效果。

4) 在步骤去蛋白液 RW1 漂洗前,直接在吸附柱 RNANE 上进行 DNase I 处理。

   RNA 纯度及浓度检测:

完整性: RNA 可用普通琼脂糖凝胶电泳 ( 电泳条件:胶浓度 1.2%;0.5×TBE 电泳缓冲液; 150v,15 分钟 ) 检测完整性。由于细胞中 70%-80% 的 RNA  rRNA  电泳后 UV 下应能 看到非常明显的 rRNA 条带。动物 rRNA 小分别约为 2 kb  1kb, 分别相当于 28S  18S rRNA。动物 RNA 样品中最大 rRNA 亮度应为次大 rRNA 亮度的 1.5-2.0 倍, 否则提示 RNA 样品的降解。出现小的弥散片状或条带消失表明样品严重降解。但是应该注意区分是提取出来的 RNA 样品本身降解了,   还是提取出来的 RNA 是完好的,    只是在电泳过程中降解的。

纯度: OD260/OD280 比值是衡量蛋白质污染程度的参考指标。高质量的 RNA,OD260/ OD280 读数在 2.1-2.2 之间 100% 纯的 RNA 比值一般是 2.2 左右(100% 纯的 RNA 比值一 般是 2.2 左右,很多公司的产品因为残留蛋白或者 DNA 较多,造成比值降低,无法达到 2.2 这 个纯度标准,因此降低要求 1.9-2.0 就凑合使用了,但是核小体的产品标准一般可以达到高水 准的 2.1-2.2 的纯度标准)。OD260/OD280 读数受测量使用的机器影响,也受测定所用稀释 溶液的 pH 值影响。微量分光光度计一般不需要稀释,不受稀释溶液的 PH 值影响。但是同一个 RNA 样品,如果测量的时候机器要求稀释后测量,假定在 10mM Tris,pH7.5 稀释溶液中测出 OD260/OD280 读数 1.9-2.1 之间, 在水溶液中所测读数则可能在 1.5-1.9 之间, 但这并不 表示 RNA 不纯。

浓度: 取一定量的 RNA 提取物,  RNase-free 水稀释 n 倍,  RNase-free 水将分光 光度计调零,取稀释液进行 OD260, OD280 测定,按照以下公式进行 RNA 浓度的计算:终浓 度(ng/μL)= (OD260)×( 稀释倍数 n)×40。

 

操作步骤(实验前请先阅读注意事项)

提示: 第一次使用前请先在漂洗液 RW 瓶和 70% 乙醇瓶中加入指定量无水乙醇 !

1. 培养细胞

A1. 贴壁细胞:不需消化,  彻底吸干净培养液体后直接加推荐量裂解液 RLT Plus(见附录一) 反复吹打细胞裂解,  取裂解后的匀浆液全部加到 DNA 清除柱 DNANE 上(清除柱放在收集管内) 直接接操作步骤 3;不方便直接裂解的培养容器,可以用细胞刮子刮下细胞,或者胰蛋白酶消化   后吹打下来收集细胞到 1.5mL 离心管。

A2. 悬浮细胞:  收集 <107 悬浮细胞到一个 1.5mL 离心管。

B.  13, 000rpm 离心 10 秒(或者 300g 离心 5 分钟 使细胞沉淀下来。完全吸弃上清, 留下细胞团,注意不完全弃上清会稀释裂解液导致产量纯度降低。

C.  轻弹离心管底部, 使细胞沉淀松散,  350μL(<5x106 细胞)或 600μL(5x106-1x107 细胞)裂解液 RLT Plus,用移液器反复吹打充分裂解 ( 直到看不细胞团为止 )。

D. 将裂解混合物全部加到 DNA 清除柱 DNANE 上(清除柱放在收集管内)。 E.  立刻接操作步骤 3。

2. 动物组织(例如鼠肝脑)

A1. 匀浆器匀浆:新鲜组织加入 350μL(<20mg 组织 ) 或者 600μL(20-30mg 组织 ) 的裂 解液 RLT Plus 后玻璃匀浆器或电动匀浆器将组织彻底研磨匀浆。

A2. 液氮研磨 + 匀浆:在液氮中研磨组织成细粉后,取适量组织细粉 (20mg/30mg) 转入装  350μL/600μL 组织裂解液 RLT Plus  1.5mL 离心管中 , 剧烈振荡 20 秒, 难裂解样品可 用移液器反复吹打匀浆。

注意: 若研磨匀浆后不溶物碎片太多,可将匀浆后裂解物 13,000rpm 离心 3 分钟沉淀可 能存在的裂解困难的碎片或者不溶物。将上清液加到 DNA 清除柱 DNANE 上(清除柱放在收集 管内)。

B. 将研磨均匀的匀浆液全部加到 DNA 清除柱 DNANE 上(清除柱放在收集管内)。 C.  立刻接操作步骤 3。

3. 立刻 13,000 rpm 离心 1 分钟,保留滤过液(RNA 在滤过液中)。

确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。

4. 较精确估计滤过液体积(通常为 350μL/600μL,滤过时候损失体积应该减去,可用移 液器吸取滤液估计体积 加入等体积的 70% 乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇 ! 此时可 能出现沉淀,但是不影响提取过程,  立即吹打混匀,  不要离心。

5. 立刻将混合物 ( 每次小于 720μL,  多可以分两次加入 ) 加入一个吸附柱 RNANE 中  附柱放入收集管中)13,000 rpm 离心 30 秒,弃掉废液。

6. 加 700μL 去蛋白液 RW1,室温放置 30 秒,13,000rpm 离心 30 秒,弃掉废液。

7. 加入 500μL 漂洗液 RW(请先检查是否已加入无水乙醇 !), 13,000 rpm 离心 30 秒, 弃掉废液。加入 500μL 漂洗液 RW,重复一遍。

8. 将吸附柱 RNANE 放回空收集管中, 13,000 rpm 离心 2 分钟,尽量除去漂洗液, 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。

9. 取出吸附柱 RNANE,放入一个干净 1.5mL 离心管中,根据预期 RNA 产量在吸附膜的 中间部位加 30-50μL RNase free water   室温放置 1 分钟,1,3,000 rpm 离心 1 分钟得到 RNA 溶液。

洗脱缓冲液体积不应少于 30  μL,体积过小影响回收效率。如果需要得到更大浓度的 RNA,  将离心得到的 RNA 溶液加回到吸附柱重复洗脱一遍。

 

附录一:贴壁培养细胞数量表

 

培养器皿

底面积(cm2  

加培养液量(mL

可获细胞量

24 孔培养板

2

1.0

5×105

6 孔培养板

9.6

2.5

2.5×106

3.5cm 培养皿

8

3.0

2.0×106

6cm 培养皿

21

5.0

5.2×106

25cm 塑料培养瓶

25

5.0

5.2×106

100mL 玻璃培养瓶

33

10.0

7×106

 

注: 一般情况下,3.5cm 直径培养皿或者更小培养容器加 350μL 裂解液 RLT Plus6cm 直径 培养皿或者更大培养容器加 600μL 裂解液 RLT Plus最大处理量不超过 107  个细胞。

 

 
 
 
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