Complex Plant RNA Kit 多糖多酚/复杂植物RNA快速提取试剂盒
货号 | 次数 |
NP08011 | 50次 |
适用范围
适用于快速提取植物组织细胞总 RNA,使用独有基因组 DNA 清除柱技术可有效清除电泳 可见 gDNA 残留,RNA 可用于反转录 PCR,荧光定量 PCR 等。
试剂盒组成、储存、稳定性
试剂盒组成 |
保存 |
50 次 |
裂解液 CLB |
室温 |
50 mL |
裂解液 RLT Plus |
室温 |
25 mL |
去蛋白液 RW1 |
室温 |
40 mL |
漂洗液 RW |
室温 |
10 mL 第一次使用前用无水乙醇稀释至 50mL |
RNase-free H2O |
室温 |
10 mL |
基因组 DNANE 清除柱 和收集管 |
室温 |
50 套 |
RNase-free 吸附柱 RNANE 和收集管 |
室温 |
50 套 |
本试剂盒在室温储存 24 个月不影响使用效果。
储存事项
不合适的储存于低温(4℃或者- 20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存 均在室温下(15℃- 25℃)进行。
避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH 值变化, 各溶液使用后应及时盖紧盖子。
产品介绍
该试剂盒基因组 DNA 清除柱技术可以有效清除 gDNA 残留,得到的 RNA 一般不需要 DNase 消化,可用于反转录 PCR、荧光定量 PCR 等实验。独特的裂解液迅速裂解细胞和灭活 细胞 RNA 酶, 离心沉淀去除多糖多酚和次级代谢产物,然后裂解混合物用乙醇调节 RNA 结合 吸附到基因组 DNA 清除柱,然后 RNA 被选择性洗脱滤过, 吸附在基因组 DNA 清除柱上的残 留 DNA 无法洗脱连同柱子一起丢弃从而清除掉 DNA。滤过的 RNA 用乙醇调节结合条件后, RNA 在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤, 去蛋白液和漂洗液将细胞代谢物,蛋白等杂质去除, 最后低盐的 RNase free H20 将纯净 RNA 从硅基质膜上洗脱。
产品特点
·完全不使用有毒的苯酚,氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。
·简捷,单个样品操作一般可在 25 分钟内完成。
·独家研发成功基因组 DNA 清除柱技术可以有效清除 gDNA 残留,得到的 RNA 一般不需 要 DNase 消化,可用于反转录 PCR、荧光定量 PCR 等实验。
·世界领先适应性极其广泛, 可以提取包括复杂中草药如石斛 / 丹参 / 雪莲 / 人参、复杂淀粉 种子如水稻 / 小麦 / 玉米种子、复杂果实如葡萄 / 蓝莓 / 草莓 / 西瓜果实、复杂抗逆植物如冬青 / 松针 / 沙棘 / 胡杨、复杂花卉月季 / 玫瑰 / 梅 / 牡丹花、复杂多糖植物紫菜 / 仙人掌 / 芦荟 / 百合鳞 茎 / 水稻种子等数百种国内外试剂盒提取失败的样品。
· 多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280 典型的比值高达 2.1~2.2, 基本无 DNA 残留 , 可用于 RT-PCR,Northern-blot,二代测序和各种实验。
注意事项
》 所有的离心步骤均可在室温完成(4℃离心也可以) ,使用转速可以达到 13,000 rpm 的 传统台式离心机,如 Eppendorf 5415C 或者类似离心机。
》 需要自备 β- 巯基乙醇,乙醇,研钵 ( 可选 )。
》 样品处理量绝对不要超过基因组清除柱 DNANE 和和 RNA 吸附柱 RNANE 处理能力, 否则造成 DNA 残留或产量降低。开始摸索实验条件时,如果不清楚样品 DNA/RNA 含量时可使 用较少的样品处理量,将来根据样品试验情况增加或者减少处理量。
》 裂解液 CLB 和 RLT Plus 和去蛋白液 RW1 中含有刺激性化合物,操作时戴乳胶手套, 避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。
》 关于 DNA 的微量残留 :
一般说来任何总 RNA 提取试剂在提取过程中无法完全避免 DNA 的微量残留(DNase 消 化也无法做到 100% 无残留) ,该 RNA 提取产品, 由于采取了本公司独特的缓冲体系和基因组 DNA 清除柱技术,绝大多数 DNA 已经被清除,不需要 DNase 消化,可直接用于反转录 PCR 和荧光定量 PCR。个别特殊情况如 DNA 含量过于丰富造成残留或者要进行严格的 mRNA 表达 量分析荧光定量 PCR,我们建议在进行模板和引物的选择时:
1) 选用跨内含子的引物,以穿过 mRNA 中的连接区,这样 DNA 就不能作为模板参与扩增反应。
2) 选择基因组 DNA 和 cDNA 上扩增的产物大小不一样的引物对。
3) 将 RNA 提取物用 RNase-free 的 DNase I 处理。
4) 在步骤去蛋白液 RW1 漂洗前,直接在吸附柱 RNANE 上进行 DNase I 柱上消化处理。 购买 DNA 酶柱上消化试剂盒 ( 货号:NP09011) 前可先索取具体操作说明书。
操作步骤(实验前请先阅读注意事项)
提示: 第一次使用前请先在漂洗液 RW 瓶加入指定量无水乙醇 !
取 1mL 裂解液 CLB 至离心管内 ( 如果 CLB 有析出或者沉淀需先置于 65℃水浴重新溶 解), 在裂解液 CLB 中加入 5% β- 巯基乙醇(1mL CLB 加 50μL β- 巯基乙醇)。颠倒混 匀后 65℃水浴中预热。多个样品按照比例放大准备。
1. 直接研磨法(实验室无液氮情况下或者柔软易研磨植物样品推荐此法):
a. 新鲜植物组织或者冰冻保存样品称重后取 100mg-200mg(水分少的样品如叶片种子等 可加 100mg-150mg,水分多的样品如草莓西瓜果实可多加一些)迅速剪成小块放入研钵,加 入 1mL CLB(已加有 β- 巯基乙醇)室温下充分研磨成匀浆,注意应该迅速研磨让组织和裂解 液 CLB 立刻充分接触以抑制 RNA 酶活性。
β- 巯基乙醇是裂解液 CLB 的关键成分,必要的时候可以提高终浓度到 10-20%。 如果特别复杂植物,可以尝试在裂解液中加入 PVP40 至终浓度 2%。
b. 将裂解物转入离心管,立即剧烈振荡 15 秒,短时放回 65℃水浴中(5-10 min),中间 偶尔颠倒 1-2 次帮助裂解。13,000rpm 离心 10 分钟,沉淀不能裂解的碎片。
c. 取裂解物上清(在不超过基因组 DNA 清除柱能力的情况下可以取更多的上清, 这样可以 提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇 (0.5 体积 ),此时可能出现沉淀, 但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
若上清表面有漂浮物,用吸头挑开吸取下面液体即可。
d. 立刻接操作步骤的步骤 3。
2. 液氮研磨法(适用广泛,提取复杂难破碎,易降解样品时推荐此法):
a. 液氮中研磨新鲜或 -70℃冷冻的材料至细粉。
b. 转移 100mg-200mg 细粉(水分少的样品如叶片种子等可加 100mg-150mg, 水分多 的样品如草莓西瓜果实可多加一些) 加至预热的裂解液 CLB(已加有 β- 巯基乙醇) 离心管中。 立即剧烈涡旋 30-60 秒或者用吸头吹打混匀裂解直得到满意匀浆结果 ( 或者电动匀浆 30 秒 ), 可以剪切 DNA,降低粘稠度和提高产量。
c. 短时放回 65℃水浴中(5-10 min),中间偶尔颠倒 1-2 次帮助裂解。 d. 将裂解物 13,000 rpm 离心 10 分钟,沉淀不能裂解的碎片。
e. 取裂解物上清(在不超过基因组 DNA 清除柱能力的情况下可以取更多的上清,这样可 以提高产量)转到一个新离心管。加入上清体积一半的无水乙醇 (0.5 体积 ),此时可能出现沉淀, 但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
若上清表面有漂浮物,用吸头挑开吸取下面液体即可。
f. 立刻接操作步骤的步骤 3。
3. 将混合物 ( 每次小于 720μL,多可以分两次加入 ) 加入一个基因组清除柱中, (清除柱放入 收集管中)13,000 rpm 离心 2 分钟,弃掉废液。
确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。
4. 将基因组 DNA 清除柱子放在一个干净 2mL 离心管内(不用 RNAse free 或者 DEPC 处理, 一般干净的新离心管即可。也可使用 RNA 吸附柱配套的新的干净收集管) ,在基因组清除柱内 加 500μL 裂解液 RLT Plus,13,000 rpm 离心 30 秒, 收集滤液(RNA 在滤液中), 用微量 移液器较精确估计滤过液体积(通常为 450-500μL 左右,滤过时候损失体积应该减去) ,加入 0.5 倍体积的无水乙醇,此时可能出现沉淀,但是不影响提取过程,立即吹打混匀,不要离心。
5. 立刻将混合物 ( 每次小于 720μL,多可以分两次加入 ) 加入一个吸附柱 RNANE 中, (吸附 柱放入收集管中)13,000 rpm 离心 2 分钟,弃掉废液。
6. 确保离心后液体全部滤过去,膜上没有残留,如有必要,可以加大离心力和离心时间。加 700μL 去蛋白液 RW1,室温放置 1 分钟,13,000rpm 离心 30 秒,弃掉废液。
7. 加入 500μL 漂洗液 RW(请先检查是否已加入无水乙醇 !),13,000 rpm 离心 30 秒, 弃掉 废液。加入 500μL 漂洗液 RW,重复一遍。
8. 将吸附柱 RNANE 放回空收集管中, 13,000 rpm 离心 2 分钟,尽量除去漂洗液 , 以免漂洗液 中残留乙醇抑制下游反应。
9. 取出吸附柱 RNANE,放入一个 RNase free 离心管中,根据预期 RNA 产量在吸附膜的中间 部位加 30-50μL RNase free water(事先在 70-90℃水浴中加热可提高产量), 室温放置 1 分钟,12,000 rpm 离心 1 分钟。
10. 如果预期 RNA 产量 >30μg, 加 30-50μL RNase free water 重复步骤 9, 合并两次洗液, 或者使用第一次的洗脱液加回到吸附柱重复步骤一遍 ( 如果需要 RNA 浓度高 )。
洗脱两遍的 RNA 洗脱液浓度高 , 分两次洗脱合并洗脱液的 RNA 产量比前者高 15-30%, 但是浓度要低 , 用户根据需要选择。
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