miRNA产品使用说明

miRNA 产品使用说明

miRNA 产品简介
miRNA mimic 是 miRNA 模拟物化学合成的成熟 miRNA 双链,即用型
miRNA inhibitor 是 miRNA 抑制物化学修饰的成熟 mi RNA 互补单链,即用型
miRNA agomir 是特殊化学修饰的 miRNA 激动剂适用于细胞、动物实验,即用型
miRNA ant agomir 是特殊化学修饰的 miRNA 拮抗剂适用于细胞、动物实验,即用型
miRNA 产品简介
miRNA mimic miRNA 模拟物化学合成的成熟 miRNA 双链,即用型
miRNA inhibitor miRNA 抑制物化学修饰的成熟 mi RNA 互补单链,即用型
miRNA agomir 是特殊化学修饰的 miRNA 激动剂适用于细胞、动物实验,即用型
miRNA ant agomir 是特殊化学修饰的 miRNA 拮抗剂适用于细胞、动物实验,即用型
运输保存
产品以冻干粉的形式,常温运输。收到产品后,请于-20~-80保存,冻干粉可以稳定保存
一年。使用前瞬时离心,用 RNase-free H2O 或灭菌 ddH2O,配制成 20μM 储存液,分装保存,
避免反复冻融 (不超过 5 次)。
1 20 μM 储存液的配置

注:如需进行高内涵筛选试验,可进行 miRNA library

使用前须知

产品以冻干粉的形式提供,由于影响结晶形态的因素很多,产品外观有些差异,甚至形态无法用肉眼可见。此为正常现象。

为避免外界因素(包括酶,极端 pH 或者温度条件等)导致产品降解,所有操作请严格遵循RNA 操作规则。实验过程中,产品最好于冰上放置,使用完毕后请于-20~-80小心保存。

 

细胞实验方法:

为了降低细胞密度、试剂用量,转染效率等因素导致的孔间差异,保证实验的可靠性和可重复性,一般建议:

1)转染实验中每个转染样品至少设置 3 个复孔;

2)接种细胞时,每孔接种的细胞数量尽量保持一致,且细胞在各孔的表面平均分布。

1.转染浓度

miRNA 产品最佳工作浓度因不同的细胞类型及研究目的而异。中实同创推荐的 miRNA mimic  初始浓度为 50nMmiRNA inhibitor 浓度为 100nM,客户可根据实验具体情况优化转染浓度,优化的范围建议为 10~200nM

注:miRNA inhibitor 往往需要用到较大的用量才能观察到较好的抑制效果,相当于 miRNA     mimic 的几倍用量,这可能与 miRNA inhibitor 竞争性抑制的作用机制及作用效率有关。因此, 当使用推荐的转染浓度没有获得预期效果时,可适当选择更高的浓度或选择 antagomir进行实验。

 

2.转染方法

 Reagent 转染 miRNA mimic  24 孔板,转染浓度为 50nM 为例,其他规格容器的试剂用量请参考表 2 ,若使用其它转染试剂,请参考对应转染试剂说明书。

1)接种细胞

a. 贴壁细胞:以 Hela 细胞为例,接种  105~5 × 105 个细胞至含有适量完全培养基的 24 孔板 培养孔中,使转染时的细胞密度能够达到 30~50%

b.  悬浮细胞:以 THP1 细胞为例,接种  105~5 × 105 个细胞至含有适量完全培养基的 24 板培养孔中。

注:1)不同细胞生长速度不同,接种数量及密度需依据细胞类型,培养时间,实验目的而且 2每孔接种的细胞数量应尽量相同,使细胞均匀分布。

2)转染

对于每个转染样品,请按以下步骤准备:

a. 稀释 mimic:用 30μl  Buffer 稀释 1.25μl 20μM miRNA mimic 轻轻混匀。 b.  混合液制备:加入 3μl Reagent ,轻轻吹打混匀,室温孵育 015min

注:1)请勿振荡,溶液可能会有浑浊,但不会影响转染;2)混合液可室温放置一段时间,但不宜超过 24h

c. 将混合液加入到无双抗完全培养基中,轻轻混匀。

注:混合液加入至原细胞培养基,一般无需移除或更换,但需依据客户具体实验情况而定。 d.  或者进行其他必要的特殊处理(如加药处理)。

e. 将培养板置于 37 CO2 培养箱中培养 24~96h(培养时间与实验目的相关)。

 2 转染 miRNA mimic 用量参考

注:实验参考用量示例 对于部分细胞类型需要进一步优化

3. 效果检测
miRNA mimic/inhibitor 作用效果往往通过功能方面检测,转染完成后 24~72 小时均可进行检测,最佳检测时间与细胞类型及研究的 miRNA 有关。以下为几种常用的 miRNA 效果检测方法:
a. 使用 qRT-PCR,基因芯片,新一代测序等方法检测靶基因 mRNA 转录水平,甚至全基因表达谱是否发生变化。
注:miRNA 可能通过抑制翻译的机制直接影响靶基因的蛋白表达水平,mimic/inhibitor 对靶基因表达的影响往往需要进一步验证。
b. 使用 Western Blot,蛋白芯片等方法检测靶基因的蛋白水平是否发生相应改变。
c. 检测细胞功能(细胞增殖、细胞凋亡、细胞迁移等)是否发生相应变化。
d. 研究 miRNA mimic 对靶基因的影响可以以验证有效的 siRNA 作为阳性对照。
e. 通过与 miRNA 靶基因双荧光素酶报告载体(中实基因可提供构建服务)共转来验证 miRNAmimic/inhibitor
动物实验方法miRNA 动物实验的体内环境复杂实验周期长对 miRNA 产品的稳定性提出了更高的要求。miRNA 动物实验方法主要分为两类,细胞移植和直接给药。中实同创推荐采用稳定性更好、可靠性更高的化学修饰 agomir antagomir 进行动物实验,具体方案需要依据实验目的及条件而定,具体用量请参考表 3
FAQ
1.如何检测 miRNA mimicinhibitoragomirantagomir 的使用效果?对目的 miRNA 进行qPCR 检测可以吗?
使用 mimic 后可以采用 qPCR miRNA 进行过表达验证,但 inhibitor 不适用。因为从工作原理上讲,inhibitor 是与 miRNA 发生结合从而抑制了 miRNA 发挥作用,它并非改变了 miRNA的生成。其效果检测可通过检测靶基因的蛋白表达水平,或者通过萤光素酶报告系统。Agomirantagomir 由于增加了化学修饰,可能会对 qRT-PCR 造成一定的影响,可能通过 qPCR 法验证使用效果。agomir 可以通过 Northern Blot 检测 miRNA 表达,antagomir 可以通过检测miRNA 的靶基因表达来验证其使用效果。
2Mimic inhibitoragomir antagomir 的阴性对照(NC)是否可以通用?一定要使用NC 吗?
不能通用,因为 mimic/agomir 是双链 RNAinhibitor/antagomir 是单链 RNA。建议要使用NC 作为对照组,以排除可能因为应激而产生的假阳性结果。3 动物实验 agomir antagomir 用量参考
 

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