甲基化测序是一种用于研究DNA甲基化修饰的方法，其原理是将基因组DNA进行处理，使未甲基化的胞嘧啶脱氨基变成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶未发生脱氨基，从而可以通过比较经重亚硫酸盐处理的和未处理的测序样本发现甲基化的位点。该方法包括重亚硫酸盐测序、基于限制性内切酶的测序和靶向富集甲基化位点测序等。其中，全基因组重亚硫酸盐甲基化测序（WGBS）是DNA甲基化研究的金标准，能够精确检测全基因组范围内单个胞嘧啶碱基的甲基化水平，为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持，可以广泛应用于个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中，也是各物种甲基化图谱研究的首选方法。
