单细胞测序技术原理

单细胞测序(scRNA-seq)技术的基本原理是对单个细胞的基因组或转录组进行测序。它包括单细胞分离、扩增测序和数据分析三个主要步骤。

 

在单细胞分离阶段,主要采用荧光激活细胞分选法(FACS)和微流控分选法(microfluidics)等技术,将单个细胞从复杂的细胞群体中分离出来。

 

接下来是单细胞测序的关键步骤,即对单个细胞的遗传物质进行均匀扩增和标记建库。这一步骤中,通常会采用逆转录反应将RNA转化为cDNA,并进行体外扩增以增加信号强度和覆盖度。在这个过程中,还会利用UMI技术,将每个mRNA条形码化,以辨识细胞中的每个单独的mRNA。

 

最后是数据分析阶段,使用专门的软件或算法对测序数据进行质控、标准化、降维、聚类、差异分析等,以揭示单细胞水平的基因表达模式和功能。

 

通过单细胞测序技术,我们能够更好地理解单细胞在生理、病理条件下的行为和特点,为未来的生物医学研究提供更丰富的数据支持。

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