taqman探针原理

TaqMan探针是一种特殊设计的探针,用于在qPCR反应中定量测定目标DNA的浓度。其原理基于荧光共振能量转移(FRET)和5'-nuclease活性。

 

TaqMan探针通常由两部分组成:一个在5'端标记的荧光染料(通常为FAM,也可以是其他染料),和一个在3'端含有与目标DNA序列互补的序列的荧光淬灭剂(一般为BHQ1、BHQ2等)。

 

在PCR扩增过程中,当核酸链缩合酶(Taq DNA聚合酶)进行DNA链合成时,TaqMan探针与目标DNA序列互补结合。在PCR的温度条件下,酶消化探针,使荧光淬灭剂与荧光染料分离,从而释放出荧光信号。

 

具体的反应过程如下:

1. 引物结合:在PCR反应的引物结合阶段,引物与目标DNA序列的两个末端结合,并形成一个特定的引物-模板复合物。

2. Taq DNA聚合酶扩增:在PCR的DNA合成阶段,Taq DNA聚合酶开始从引物的3'端向5'端移动,合成新的DNA链。当聚合酶到达TaqMan探针所在的位点时,它开始酶解附近的探针。

3. 酶解探针:聚合酶具有5'-nuclease活性,当其酶解探针的DNA链时,荧光染料和荧光淬灭剂之间的共振能量转移被破坏,导致荧光信号被释放出来。

4. 荧光信号检测:PCR仪实时监测每个反应管中的荧光信号强度。信号强度与PCR反应中目标DNA的初始浓度成正比,从而可以通过荧光信号的强弱来定量测定目标DNA的浓度。

 

利用TaqMan探针的这种原理,可以准确地测定目标DNA的浓度,并且具有高灵敏度和特异性。同时,TaqMan探针还能够在同一反应中同时检测多个目标序列。

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