二代测序文库构建流程

二代测序文库构建流程大致包括以下步骤:

 

1. 样品提取:从样品中提取DNA,目前常用的DNA提取方法有三种,分别为化学、物理和生物学方法。

 

2. DNA片段断裂:将长链DNA切成较短的DNA片段,通常长度为400-600 bp。片段断裂可以使用多种方法实现,如化学法、机械法、限制性内切酶切等。

 

3. 连接适配器:将DNA样品的两端连接适配器,以便于进行高通量测序。连接适配器的方法有多种,如ligase连接、酵母使用技术、导向连接技术等。

 

4. PCR扩增:将带有适配器的DNA片段扩增到充分的数量,便于下一步文库纯化。选择合适的PCR方法和环境因素对PCR扩增的效率和特异性有着重要的影响。

 

5. 文库纯化:将PCR扩增的DNA片段独立出来,去除掉含有不必要的杂质。常用的纯化方法包括:酚/氯仿、硅胶柱、磁珠法、凝胶切割和流式细胞仪分离等。

 

6. 文库鉴定:检测文库的重复度、插入文库的DNA片段大小和插入浓度等因素。文库鉴定的方法有多种,如聚合酶链反应(PCR)、UV分光光度计、凝胶电泳和实时荧光定量PCR等。

 

7. 二代测序:最后一步是将文库进行高通量测序,得到序列数据。

 

需要注意的是,在进行文库构建时,应该注意样品的安全性,保留足够的原材料以便后续检查和验证;在每一个步骤中都应该注意和控制样品中的质量和量,避免出现异常;此外,如果出现问题需要及时识别并调整实验措施,保质保量完成文库构建流程。

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