常用的核酸染料及毒性介绍
在分子生物学中,电泳实验是核酸的分离、纯化及蛋白识别的有效方法,可以与凝胶成像系统配合使用,也可以单独使用,具体根据实验目的来选择。琼脂糖凝胶电泳是通过DNA片段在琼脂糖介质电场中的电泳速率大小来判断 DNA分子量大小的实验方法。
琼脂糖凝胶中常用的染料有哪些?
1.溴化乙锭 :溴化乙锭通常习惯简称“EB”,是核酸染色及凝胶成像分析中普遍使用的染料。
EB染料属于核酸分子嵌入型染色剂,且具有DNA诱导突变的作用。研究发现,长期使用溴化乙锭或长期处在含溴化乙锭的实验环境中,会对人体造成较大的伤害,甚至增加遗传方面的致畸率。所以在实验室中,使用EB类染料时要做好全套防护,实验后的废液、耗材等也要严格管理,切勿随意丢弃,以防对他人造成间接伤害。
2.吖啶橙染料:吖啶橙染料主要用于RNA 染色、荧光染色以及细胞凋亡实验等,从理论上讲虽然该染料的毒性远低于 EB,但是在实验室也不可粗心大意。
3.荧光核酸染料:荧光核酸染料在化学发光、凝胶成像、电泳等相关实验中应用较为普遍。 由于分子量较大,且具有特殊的油性分子,很难渗透细胞膜进入动物细胞内,所以这种染料相对较为安全,实验后的废弃物对周边环境的危害性也较小。
4.SYBR 染料:SYBR具有灵敏度好,成本低廉,毒性低,信噪比较高,并且实验时无需进行洗脱操作等特点,广泛应用于凝胶电泳分析实验中。但是作为花箐素类核酸染料其稳定性较差,在一定光诱导下也会产生强诱变力,易造成DNA序列上的基因位点突变。
常用的这几种核酸染料相信每个实验室都使用过,但是对于核酸染料的危害也要注意,实验中做好实验防护也很关键。
核小体(北京)生物技术有限公司的NucleoRed核酸染料既可用于前染 (precast gel staining),也可用于后染 (post gel staining)。NucleoRed 在性能和可操作性方面均超过 SYBR 或 EB。通常,NucleoRed 最显著的特性是其在多种条件下的高灵敏性和稳定性。另外,与 GelGreen 、EvaGreen 一样,相对 EB 或 SYBR,NucleoRed 诱导突变的能力极低。独特的油性大分子特点使其不能穿透细胞膜进入细胞内,艾姆斯氏试验结果也表明该染料的诱变性远小于EB。
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